Een van de belangrijkste Scientology gebruiken wordt auditing genoemd, ontleend aan het Latijnse audire, dat luisteren betekent. De persoon die vragen beantwoordt die hem door de auditor ("iemand die luistert") worden gesteld, brengt zichzelf in een hogere toestand van verstandelijk en geestelijk vermogen, en kan daardoor herstellen van psychosomatische kwalen. Dit heeft veel gemeen met een aantal van de jongere shinto-godsdiensten die voortkomen uit de Yui-Itsu tak van het shinto, die in Japan ongeveer 1400 jaar oud is.

De Scientology gedachte ontstond tijdens Hubbards eerste navorsingen in de jaren 30, dezelfde periode waarin de jongere shinto-godsdiensten op zoek waren naar een manier om godsdienstige gebruiken toe te passen om de geest gezond te maken. Auditing begon in de Verenigde Staten in 1950, toen het boek Dianetics: The Modern Science of Mental Health werd uitgegeven. In dit boek geeft Hubbard aan, hoe iemand de zogeheten staat van Clear kan bereiken ­ dat wil zeggen, zich bevrijden van wat wordt genoemd het reactieve verstand. Dit kan ongeveer worden vergeleken met de staat van "Satori", of zelfs "Naikan", bij het boeddhisme. Of met de meditatie bij sommige shinto-godsdiensten, waar iemand onder leiding van een leraar mediteert over de ervaringen in zijn kinderjaren of zijn eerdere levens, om zich een zelfbeeld te verschaffen van wat hij nu is. Auditing, dat ook kan worden omschreven als het in herinnering roepen van iemands verleden, om het even of dit de kinderjaren zijn of eerdere levens, kan eveneens leiden tot een soortgelijke bezinning op en begrip van iemands huidige plaats in het leven.

Hoe de auditing moet worden uitgevoerd, wordt aan de aspirant onderwezen in studieruimtes van Scientology, die academie of cursuszaal worden genoemd. Daar leest de onderwezene onder leiding van een coördinator over de auditing-technieken en leert deze in praktijk brengen. Auditing houdt in, dat een ervaren auditor iemand die niet Clear is vragen over diens verleden laat beantwoorden. De persoon die deze auditing ondergaat wordt de "preclear" genoemd, omdat hij nog niet Clear is. Wanneer de preclear de vragen die de auditor hem stelt beantwoordt, ervaart hij dit als een bevrijding van stress, een verbetering van zijn gemoedsrust, en algemeen geestelijk welbevinden. De tijd die nodig is om een bekwaam auditor te worden varieert, maar het kan maanden of zelfs jaren duren, afhankelijk van het bekwaamheidsniveau en de nauwkeurigheid die de auditor wil bereiken. Bij de Oomoto godsdienst wordt het "Naikan" nog altijd toegepast om jeugdige delinquenten te reclasseren en door regionale overheidsinstanties voor dit doel aanbevolen. Hier dringt zich andermaal de vergelijking op. Ook Scientology kent reclasseringsprogramma's voor jeugdige delinquenten, die op veel plaatsen in de wereld worden uitgevoerd. Natuurlijk hebben Naikan en auditing punten van overeenkomst, maar ze zijn fundamenteel verschillend. Dit is echter een voorbeeld waaruit blijkt, hoe twee godsdiensten hetzelfde probleem vanuit twee verschillende culturen benaderen en toch uitkomen op oplossingen die duidelijk raakvlakken hebben. Bij auditing vertelt de ondervraagde de auditor zeer gedetailleerd over de problemen waarmee hij in het leven sinds zijn verleden is geconfronteerd, terwijl bij Naikan iemand onder leiding van een leraar in zichzelf keert. Het eindresultaat voor beiden is een verbeterde geesteshouding en herleving van ethisch gedrag.

Seicho-no-Ie kent een gebruik, genaamd "Sin-So-Kan," waarbij iemand erin wordt getraind zijn verleden onder ogen te zien. Ook dit heeft bepaalde overeenkomsten met auditing. In beide gevallen moet men het eigen verleden onder ogen zien. Scientology kent een geleidelijke weg naar de verlichting, die de Brug naar Totale Vrijheid wordt genoemd. Wanneer iemand zich over deze brug begeeft, door zich te laten auditeren en te leren hoe auditing uit te voeren, is het eindresultaat niet alleen de grote verlichting, maar ook een spirituele existentie, vergelijkbaar met "Chin-kon-Kishin", het grote geheim van shinto, dat zoveel betekent als "het bevredigen van de menselijke geest, zodat de mens kan terugkeren tot een goddelijke staat". Dit vertoont een grote overeenkomst en wordt door diverse shinto-godsdiensten beoefend, met inbegrip van Hakke shinto dat teruggaat tot het jaar 1025 n.Chr.
 

Mensen tot betere mensen maken met behulp van de kunst van spirituele genezing is in Japanse godsdiensten geen vergeten gebruik, wat bij een aantal andere godsdiensten wel het geval is. In Japan kennen godsdiensten zoals Seicho-no-Ie, Sekai-Kyusei-kyo, Shinto-tenkokyo, Ananai-kyo en andere, alle gebruiken die leiden tot de staat van Chin-kon-Kishin. Het aantal aanhangers ligt rond de 20 miljoen. Hoewel de toegepaste technieken kunnen verschillen, komen de beoogde resultaten sterk overeen met die van de Scientology gebruiken, auditing en het de leden stap voor stap laten oversteken van de Brug naar Totale Vrijheid.

Ook andere vooraanstaande wereldgodsdiensten kennen voor deze geestestoestand een omschrijving. In de islam kent men de uitdrukking "Imam Zamam", waarmee een persoon wordt bedoeld die een zodanige staat van verlichting heeft bereikt, dat hij alle zeven betekenissen van de heilige Koran kan doorgronden.

Bij de christelijke kerkgenootschappen moet men ook zijn verleden onder ogen zien. Ook hier is weer een overeenkomst te vinden met Scientology, dat eveneens een op biecht gelijkende procedure kent. Iemand moet terugkijken op zijn verleden, zich ten overstaan van een andere persoon ­ de auditor ­ hierover uiten, en zijn daden erkennen. De uitkomst is bij beide geloofsrichtingen dezelfde ­ reiniging van de geest en herrijzenis in het leven.

Dit brengt ons weer terug bij de profetie van Boeddha, die voorspelde dat eens Metteya de mens zou bevrijden van wat hem in de weg staat. In Japan bestaat een verschil tussen de Metteya profetie en die van de Pali. In het laatste geval houdt de profetie niet zozeer in dat iemand noodzakelijkerwijs als persoon zal terugkeren, maar meer dat er voor de mens een manier zou bestaan om tot de verkondigde spirituele staat terug te keren. Veel Japanse godsdiensten hebben al naar dit aangekondigde gebeuren uitgezien, zowel boeddhisten als shintoïsten. Scientology heeft een methode om de spirituele bekwaamheid van de mens te verhogen. Japan is een land waar godsdiensten het accent leggen op het verhogen van iemands spirituele bekwaamheid. Vanuit Japans gezichtspunt is Scientology alleszins een godsdienst, vergelijkbaar met andere die hier reeds bestaan.